Src Homology 2 (SH2) - компактні глобулярні домени, які беруть участь у міжклітинній сигналізації та відіграють важливу роль як посередники специфічних протеїн-протеїнових взаємодій. Вони складаються зі 100-та амінокислот, які формують 7 beta-складок і 2 alpha-спіралі. Домени SH2 містять 2 висококонсервативні ділянки кишені зв'язування - pTyr і pTyr+3. Знання структури білкових комплексів є важливим кроком у розумінні механізмів їх функціонування. З використанням in silico методів проаналізовано амінокислотні послідовності сайту зв'язування доменів SH2 і ділянки, прилеглі до нього. Усі домени SH2 було розподілено на групи за подібністю сиквенсів. Аналіз консервативності й ідентичності доменів SH2 виявив ділянки послідовностей, які притаманні всім доменам, і ділянки, притаманні лише деяким доменам. Окрім того, дослідження їх поверхні засвідчило, що найбільш консервативні ділянки займають найменшу площу. Одержані результати вказують на здатність доменів SH2 розпізнавати не тільки лінійні фосфопептидні послідовності, що відкриває нові уявлення стосовно інтерпретації можливих мехаінізмів взаємодії доменів SH2 з лігандами (наприклад, можливість зв'язування з протеїнами або лігандами не тільки в межах сайту зв'язування домену).

  Повний текст PDF - 3.414 Mb    Зміст випуску     Цитування публікації

  Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"