Наукова періодика України Вісник Львівського університету


Rokytskyy I. 
Optimal models of nucleotide and amino acid substitution for sequences derived from actinobacterial genera / I. Rokytskyy, B. Ostash // Вісник Львівського університету. Серія біологічна. - 2016. - Вип. 72. - С. 75-81. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/VLNU_biol_2016_72_11
Бактерії роду Streptomyces становлять один із найбільших і найдетальніше вивчених таксонів. Вони відомі як джерела малих молекул, що виявляють активність проти бактерій, червів, пухлин і т. д. У даний час більше сотні стрептоміцетних і більше 1000 актинобактеріальних геномів доступні через GenBank, і це число швидко зростає. Це багатство секвенованих даних відкриває двері для всіх видів молекулярно-еволюційних аналізів у межах актинобактерій. Тим не менш, щоб бути правильними і значущими, такі аналізи мають базуватися на адекватних моделях заміщення - наборі правил (у вигляді таблиць), які пояснюють, як символи (нуклеотидні або амінокислотні залишки) замінюють один одного в часі. Досі не представлено підбір оптимальних моделей заміщення для GC-багатих актинобактеріальних геномів, томуа робота має на меті заповнити цю прогалину. Порівняно кілька вибірок різних генів і білків та проведено пошук моделей заміщення, які найкраще описують набір даних.
  Повний текст PDF - 616.352 Kb    Зміст випуску     Цитування публікації

Цитованість авторів публікації:
  • Rokytskyy I.
  • Ostash B.

  • Бібліографічний опис для цитування:

    Rokytskyy I. Optimal models of nucleotide and amino acid substitution for sequences derived from actinobacterial genera / I. Rokytskyy, B. Ostash // Вісник Львівського університету. Серія біологічна. - 2016. - Вип. 72. - С. 75-81. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/VLNU_biol_2016_72_11.

      Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"
     
    Відділ інформаційно-комунікаційних технологій
    Пам`ятка користувача

    Всі права захищені © Національна бібліотека України імені В. І. Вернадського