Зазначено, що самоасоціати компонентів нуклеїнових кислот (НК) (стекинг тримери та тетраметри основ НК) і короткі фрагменти НК є наночастинками (їх лінійні розміри більше 10 ангстрем). Сучасні квантово-механічні методи та програми дозволяють здійснювати розрахунки систем, що містять 150 - 200 атомів, із достатньо великим базисом (наприклад, 6-31G<^>*). Мета роботи - виявлення особливостей молекулярної та електронної структур, енергетичних характеристик наночастинок компонентів НК. Виконано неемпіричні розрахунки молекулярної структури та взаємодій в стекинг димері та тримері пар нуклеотидів, а також в стекинг димері, тримері та тетраметрі пар основ НК. Проведені розрахунки молекулярної структури димеру та тримеру пар нуклеотидів показали, що міжплощинна відстань в структурах, що вивчалися, в середньому дорівнювала 3,2 ангстрем, кут спіральності в тримері - 30 ангстрем, відстань між атомами фосфору в сусідніх ланцюгах 13,1 ангстрем. Розраховано енергії горизонтальних взаємодій у цих димерах і тримерах. Проаналізовано міжплощинні відстані та кути між основами та їх парами у стекинг димері, тримері та тетраметрі пар основ НК. Аналіз горизонтальних і вертикальних взаємодій у розрахованих коротких олігомерах пар основ НК показав значну роль перехресних взаємодій у стабілізації вивчених структур. Внесок перехресних взаємодій в горизонтальні взаємодії збільшується з подовженням олігомеру. Показано, що у складі наночастинок їх компоненти одержують електричний заряд. В електронних спектрах наночастинок можуть з'явитись довгохвильові малоінтенсивні смуги.

  Повний текст PDF - 621.277 Kb    Зміст випуску     Цитування публікації

  Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"