Розроблено та впроваджено новий вид ДНК-маркерів, які грунтуються на аналізі поліморфізму I інтрону генів <$Ealpha>-тубуліну. Здійснено біоінформаційний пошук генів <$Ealpha>-тубуліну Arabidopsis thaliana, Linum usitatissimum, Oryza sativa, Solanum tuberosum, Solanum lycopersicum. Показано, що більшість генів <$Ealpha>-тубуліну містили по 4 - 5 екзонів та 3 - 4 інтрони. Виявлено декілька винятків, зокрема ген <$Ealpha>-тубуліну A. thaliana TUBA6 містить лише 2 екзони та 1 інтрон, а ген TUBA4 - 3 екзони та 2 інтрони. Встановлено, що довжини інтронів значною мірою відрізняються, навіть у межах одного виду. Також виявлено певну системність у кількості пар нуклеотидів екзонів. На основі даних аналізу екзонінтронної структури генів <$Ealpha>-тубуліну розроблено пару універсальних вироджених праймерів та проведено оцінку поліморфізму довжини I інтрону генів <$Ealpha>-тубуліну в Arabidopsis thaliana та різних сортів L. usitatissimum, О. sativa, S. tuberosum та S. lycopersicum. Показано утворення видоспецифічних ДНК-профілів, які містили різну кількість ампліконів I інтрону генів <$Ealpha>-тубуліну. Діапазон варіювання розмірів ампліконів фрагментів інтронів, наприклад у S. tuberoum. становив 150 - 2000 п. н. Природа появи великих фрагментів ДНК (понад 1500 п. н.) у електрофоретичних спектрах проаналізованих видів потребує додаткових досліджень, оскільки такі фрагменти в цілому не передбачені результатами біоінформаційного аналізу. Виявлено поліморфізм довжини окремих фрагментів інтронів <$Ealpha>-тубуліну серед сортів L. usitatissimum, О. sativa, S. lycopersicum, S. tuberosum, що надало змогу диференціювати їх між собою. Одержані результати підтверджують доцільність подальшого використання поліморфізму довжин I інтрону генів <$Ealpha>-тубуліну для генотипування й оцінки генетичної різноманітності різних видів та сортів вищих рослин. Розроблена ДНК-маркерна система є універсальною й поєднує в собі надійність, швидкість одержання вихідних даних і простоту їх аналізу.

  Повний текст PDF - 836.673 Kb    Зміст випуску     Цитування публікації

  Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"