Молібденіт є головним рудним мінералом грейзенів, кремнієво-калієвих і лужних метасоматитів, а також грейзенізованих пегматитів Українського щита. Вивчено кристали молібденіту із майже 100 проявів молібденової мінералізації на Українському щиті. Основні прості форми вивчених кристалів молібденіту: {0001}, {<$E10 1 Bar 0>}, {<$E10 1 Bar 1>}, {<$E10 1 Bar 2>}, {<$E10 1 Bar 3>}, {<$E10 1 Bar 5>}, {<$E30 3 Bar 2>}. Габітусні типи кристалів молібденіту: пінакоїдальний, призматично-пінакоїдальний і призматичний. Домінують пластинчастий і таблитчастий обриси кристалів. Майже у всіх рудопроявах і родовищах переважають пластинчасті пінакоїдальні кристали молібденіту, тільки в окремих рудопроявах дещо зростає кількість таблитчастих призматично-пінакоїдальних, іноді фіксуються стовпчасті призматичні кристали, а дипірамідально-пінакоїдальні дуже рідкісні. Кристали молібденіту із Ново-полтавського та Вирівського рудопроявів молібдену мають округлий обрис пластинок. У структурному відношенні найбільш поширеною модифікацією серед кристалів молібденіту Українського щита є гексагональний політип 2H. Він трапляється в кристалах молібденіту із різноманітних порід, утворених за різних геолого-структурних умов. Ромбоедричний політип 3R і зростки політипів 3R + 2H характерні для кристалів молібденіту Вербинського родовища, вони встановлені ще в середньозернистих молібденітах із кварцових прожилків Сергіївського золоторудного родовища. Також зростки політипів 2H + 3R зафіксовані в молібденітах із кори вивитрювання Капітанівського рудного поля. У молібденітах виявлено відносно широкий спектр елементів-домішок: Re, Os, Ru, Se, Te, Ag. Підвищений вміст Re та Os визначено в молібденітах, які локалізуються серед габроїдів, метабазитів і ультраосновних лужних порід.