Наукова періодика України Microbiological journal


Полищук Л. В. 
Гомологичность первичной структуры бета-галактозидазного гена Streptomyces globisporus 1912 и аналогичных генов стрептомицетов / Л. В. Полищук, О. И. Бамбура // Мікробіологічний журнал. - 2019. - Т. 81, № 2. - С. 41-50. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/MicroBiol_2019_81_2_6
Цель исследования - определить степень гомологии нуклеотидных последовательностей <$Ebeta>-галактозидазных генов ряда штаммов стрептомицетов и аналогичного гена S. globisporus 1912-4Crt. Проанализированы геномы 30 штаммов стрептомицетов с различной степенью таксономического родства S. globisporus 1912-4Crt. Компьютеризированный сравнительный анализ первичных структур геномов 31 стрептомицета из баз данных "Nucletide collection" и "Whole-genome shotgun contigs" на сервере NCBI проводили с помощью программ (blastn и bl2seq) из пакета BLAST. Установлена значительная степень гомологии (от 66 до 97 %) последовательностей бета-галактозидазных генов большинства (90 %) исследованных штаммов стрептомицетов аналогичному гену S. globisporus 1912-4Crt. Из них только первичные структуры бета-галактозидазных генов штаммов - членов S. albovinaceus субклады имели степень гомологии их структур референснаму гену выше 95,5 %. Установлено, что в геномах штаммов из представленной произвольной выборки присутствует до 7 бета-галактозидазных генов. Однако в геномах большинства (51,6 %) штаммов выявлено по одному бета-галактозидазному гену, а у 3 из них структуры этих генов не имеют гомологии со структурой референсного гена S. globisporus 1912-4Crt. Выводы: гомологичность первичных структур бета-галактозидазных генов штаммов стрептомицетов и аналогичного гена S. globisporus 1912-4Crt зависит от их сродства со штаммом S. globisporus 1912. Например, первичные структуры бета-галактозидазных генов штаммов - членов S. albovinaceus субклады были наиболее идентичны структуре референтного гена (выше 95,5 %).
  Повний текст PDF - 412.957 Kb    Зміст випуску     Цитування публікації

Цитованість авторів публікації:
  • Полищук Л.
  • Бамбура О.

  • Бібліографічний опис для цитування:

    Полищук Л. В. Гомологичность первичной структуры бета-галактозидазного гена Streptomyces globisporus 1912 и аналогичных генов стрептомицетов / Л. В. Полищук, О. И. Бамбура // Мікробіологічний журнал. - 2019. - Т. 81, № 2. - С. 41-50. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/MicroBiol_2019_81_2_6.

      Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"
     
    Відділ інформаційно-комунікаційних технологій
    Пам`ятка користувача

    Всі права захищені © Національна бібліотека України імені В. І. Вернадського