Гени ячменю Rpg5, Adf3 та RGA1, що забезпечують стійкість до багатьох патотипів стеблової іржі, були клоновані кілька років тому, але було невідомо чи наявні їх гомологи в пшениці та інших споріднених видах. Наведено результати біоінформаційного пошуку по визначенню гомологів Rpg5, RGAI та Adf3 в геномах Triticum aestivum та кількох диких злаків, які селекціонери зазвичай використовують як джерело стійкості до стеблової іржі і які наразі є доступними в базах даних. Визначено, що послідовність Q9FEC6 з Th. elongatum і послідовність Q43655 з T. aestivum є високоідентичними гомологами білкової послідовності Adf3. Послідовність M8А999 з T. urartu і послідовність W5FCU1 з T. aestivum виявились гомологами повної білкової послідовності Rpg5, але ідентичність кіназних доменів цих послідовностей є нижчою, ніж для інших доменів. Окремий аналіз кіназної частини Rpg5 не надав чітких доказів наявності ортологів Rpg5 серед інших видів злаків. Послідовність M7ZZX9 з T. urartu і послідовності W5FFP0 та W5FI33 з T. aestivum виявились гомологами RGA1. Аналіз активних сайтів дозволив визначити різницю між білковими послідовностями Rpg5, RGAI, Adf3 та послідовностями їх гомологів.

  Повний текст PDF - 3.099 Mb    Зміст випуску     Цитування публікації

  Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"