Работа Н.Лихачева, посвященная приказной системе, стала первым серьезным исследованием на эту тему в отечественной историографии. В ней с максимально возможной полнотой собраны сведения о дьяках Разрядного приказа вплоть до начала XVII века, изучен вопрос о московском дьячестве и его социально-политической роли, опровергнуты некоторые стереотипы в этой области, бытовавшие в русской исторической науке еще с XVIII века. Затронута и такая тема, как различные редакции родословных книг и значение родословных росписей XVII века как генеалогического источника.

Н. Н. Лихачев - русский историк и искусствовед. Основная ценность трудов Лихачева - в богатстве фактического материала и наблюдениях конкретно-исторического характера. Его реферат "Манера письма Андрея Рублева", читанный 17 марта 1906 года, был значительным вкладом в изучение древнерусской живописи.

Работа «Библиотека и архив Московских Государей в XVI столетии» была написана в 1894 году, когда Лихачев являлся профессором Петербургского археологического института. Автор скрупулёзно анализирует все доступные зарубежные и отечественные известия о библиотеке Московских царей - от свидетельства Феофана Грека до сообщения профессора Дабелова о найденном каталоге утерянной библиотеки - и даёт оценку их исторической достоверности. Если Белокуров скептически относился к самой возможности существования «либерии», то Лихачев признаёт большинство сведений о царской библиотеке достоверными, но склоняется к мысли, что либерия погибла еще в XVI веке и вероятнее всего сгорела при пожаре 1571 года.