Індекс рубрикатора НБУВ: Е0*446.1в647

Рубрики:

Загальна біологія

Шифр НБУВ: Ж26161 Пошук видання у каталогах НБУВ 

Описана схема функционирования генетического оператора, которая гарантирует восстановление в популяции строительного материала (генов), утраченного во время эволюции. Данный оператор обеспечивает поддержку разнообразия популяции на достаточно высоком уровне, тем самым позволяя генетическому алгоритму решать задачи даже при использовании популяций малых размеров. Приведены сравнительные тесты предложенной схемы на различных функциях, включая пять тестовых функций Де Джонга.

Висвітлено метод розкладання популяцій, що розщеплюються на компонентні генотипи за Л. Пауерсом, який дозволяє одержати вірний менделєвський опис наслідування кількісних різниць, з використанням якого можливий селекційний прогноз.

Індекс рубрикатора НБУВ: Е0*446.33 + Р252.65

Рубрики:

Загальна біологія

Порушення обміну речовин і енергії

Шифр НБУВ: Ж60216 Пошук видання у каталогах НБУВ 

Розроблено загальний алгоритм оптимізації методів мультилокусного ДНК-профілювання та запропоновано методику стандартизації протоколів виділення геномної ДНК. Визначено оптимальні діапазони концентрацій реагентів реакційної суміші за умов проведення ISSR- і RAPD-PCR. Розроблено показники генетичної мінливості та популяційної різноманітності зубра, бізона та сірої української породи великої рогатої худоби. Проведено порівняльний аналіз інформативності ISSR- і RAPD-методів для міжвидової диференціації тварин. Досліджено молекулярно-генетичний поліморфізм п'яти популяцій дикої уссурійської та 14-ти сортів культурної сої за допомогою ISSR- і RAPD-методів. Висвітлено генетичні взаємовідносини між генотипами сої на базі одержаних спектрів ампліфікації та розраховано відповідні генетичні дистанції. Розроблено методику генетичної паспортизації сортів сої. Проведено порівняння дискримінаційного потенціалу використаних у роботі ПЛР-методів для дослідження геномів рослин і тварин.

Відомий американський популяційний генетик, керівник Генографічного проекту Національного географічного товариства США Спенсер Велз на основі передових наукових досліджень показує, як сучасні дії людства (як успіхи, так і проблеми) визначаються доісторичною еволюційною спадщиною людини та фундаментальними рішеннями щодо способу життя, які людство ухвалювало в минулому. Автор наголошує, що широкий спектр явищ сучасного життя - від антропогенної зміни клімату до епідемії ожиріння та психічних розладів - корениться в еволюційній історії, в яку зараз можна зазирнути завдяки здобуткам у вивченні людського геному. Довгочасні еволюційні тенденції порушують фундаментальні питання щодо найближчого майбутнього людства.

Викладено уявлення про те, що процеси кросинговеру та динаміки мобільних генетичних елементів перебувають у тісному взаємозв'язку. Поведінка мобільних елементів геному впливає на процеси гомологічної рекомбінації як безпосередньо в момент активації, так і внаслідок змін, що відбуваються в геномах у результаті активного переміщення автономних нуклеотидних послідовностей.

Індекс рубрикатора НБУВ: Е0*446.3

Рубрики:

Загальна біологія

Шифр НБУВ: Ж22412/а Пошук видання у каталогах НБУВ 

Індекс рубрикатора НБУВ: Е0*446.1в641,025

Рубрики:

Загальна біологія

Шифр НБУВ: Ж22412/а Пошук видання у каталогах НБУВ 

Одержані здебільшого на невеликих вибірках дані аналізу ізосамкових ліній свідчать, що Drosophila melanogaster із різних природних популяцій світу переважно інфікована єдиним генотипом ендосимбіотичної бактерії WolbachiawMel, який, як вважається, розповсюджувався одночасно з 2-м гаплотипом мтДНК дрозофіли, заміщуючи групу генотипів бактерії wMelCS, яка асоційована з 1-м гаплотипом мтДНК. У деяких популяціях спостерігається присутність обох генотипів, що вказує на неповне або незавершене заміщення. Використання прийнятого підходу показало переважання генотипу wMel у природних популяціях D. melanogaster України. Проте генотипування на більшій вибірці ізосамкових ліній продемонструвало присутність обох генотипів бактерії у дрозофіл популяції м. Умань. Такий результат може свідчити про значно більше поширення генотипу wMelCS у природних популяціях дрозофіли України і світу, а також про існування механізмів, які забезпечують збереження цього генотипу бактерії у популяціях дрозофіл.

Однонуклеотидні поліморфізми є важливою та вагомою формою генетичної варіабельності ДНК серед індивідів. Розроблено велику кількість методів для генотипування даних поліморфізмів, але кількість універсальних і недорогих обмежена. Мета роботи - дизайн олігонуклеотидних зондів та розробка діагностичних методик для аналізу поліморфних варіантів генів MTHFR, F5, F2 з використанням мультиплексної лігазної реакції. У дослідженні застосовано методи: гібридизацію, лігазну реакцію. Розроблено дизайн специфічних LPO та RPO олігонуклеотидних зондів та праймерів, підібрано склад та концентрації ключових компонентів реакційної суміші для MLPA реакції, а також оптимальні температурно-часові режими. Розроблені методики апробовані на зразках ДНК з різними алельними варіантами досліджуваних поліморфізмів з використанням референсних зразків ДНК. Висновки: розроблені методики ідеально підходять для генотипування вибіркових SNP, яке, зазвичай, проводиться в невеликих науково-дослідних лабораторіях, а також можуть бути використані для створення різних тест-систем ДНК-маркерів.

Кооперативна поведінка є однією з найбільш часто використовуваних та поширених рис для багатоагентних систем. У деяких випадках поява такої поведінки пов'язана із поділом населення на співіснуючі субпопуляції [1, 2]. Групова взаємодія може набувати не лише форми антагоністичного конфлікту, але й зумовлюватися генетичним дрейфом, який приводить до конкуренції поведінкових стратегій та можливої асиміляції [3]. Продемонстровано різні види залежностей між групами агентів та їх поведінковими стратегіями. Використано методологію спостереження за динамікою агентного генотипу [2], відповідно до якої популяція у просторі генотипів може мати вигляд хмари точок, кожна точка якої відповідає одній особині. Розглянуто динаміку центроїда населення - центра хмари генотипу. Аналіз таких траєкторій може сприяти дослідженню різних режимів існування популяції та їх зародження.

З позицій уявлень загальної біології проаналізовано проблему хронічних хвороб ("хроніки"). В межах такого аналізу сформовано і обгрунтовано уявлення про те, що хроніка є еволюційно вироблений механізм очищення популяції, виду від мутаційного вантажу. Це досягається виключенням систем самовідновлення в організмі, який довго не відновлюється за впливу на нього природних факторів. Відповідно хроніка за природних умов перетворюється на маркер прискореної елімінації її носія.

Мета дослідження - вивчення асоціації поліморфізму ss469415590 гена IFNL4 з ефективністю лікування пег-інтерфероном/рибавірином в групі пацієнтів, хворих на хронічний гепатит C. Група дослідження складалася з 92 неспоріднених пацієнтів, моноінфікованих вірусом гепатиту C генотипу 1: група "випадки" - 29 пацієнтів з пізньою або відсутньою вірусологічною відповіддю; група "контроль" - 63 хворих зі стійкою вірусологічною відповіддю. Матеріалом дослідження була геномна ДНК. Генотипування проводили з використанням алель-специфічної ПЛР. Статистичний аналіз здійснювали з використанням статистичних пакетів GENEPOP і OpenEpi. Одержані результати показали, що генотип ss469415590A G/AG асоційований з поганою вірусологічною відповіддю (OR = 3,62; ДІ 95 %: 1,12 - 11,67) на терапію пег-інтерфероном/рибавірином у хворих на хронічний гепатит C з України.

Індекс рубрикатора НБУВ: Р410.140.45-5 + Р410.13-5 + Е0*446.33

Рубрики:

Інфаркт міокарда

Хвороби міокарда

Загальна біологія

Шифр НБУВ: Ж22945 Пошук видання у каталогах НБУВ 

Індекс рубрикатора НБУВ: Р410.09 + Е0*446.33

Рубрики:

Серцево-судинна недостатність

Загальна біологія

Шифр НБУВ: Ж22945 Пошук видання у каталогах НБУВ 

Наведено загальну характеристику положень із генетики популяцій тварин, зокрема надано історичну довідку розвитку цієї наукової гілки. Розглянуто теоретичні засади популяційної генетики, а також особливості та різновиди спадкової гетерогенності популяцій тварин. Наведено основи оцінки генетичної мінливості та методики феноаналізу. Охарактеризовано вплив еволюційних факторів і підроздільності популяцій на їх генетичну структуру. Описано генетичний вантаж популяцій. Розглянуто питання видо- та породоутворення, а також основи генетики кількісних ознак. Висвітлено питання генетики популяцій найбільш поширених сільськогосподарських тварин України та збереження їх генофонду.

Мета дослідження - створення панелі інформативних STR-маркерів локусу HLA для аналізу геномних перебудов за різних типів злоякісних пухлин, а також для вибору HLA-сумісного спорідненого донора для алогенних трансплантацій. Попередній скринінг шести передбачуваних STR-маркерів, розташованих в проксимальному, центральному та дистальному відділах хромосомної області HLA (6p21.31), проводили за допомогою електрофорезу ПЛР-фрагментів в агарозному гелі. Точне генотипування найбільш перспективних STR-маркерів проводилося шляхом електрофоретичного фракціонування ПЛР-фрагментів у поліакриламідному гелі на автоматичному лазерному аналізаторі. На підставі одержаних результатів відібрано 3 STR-локуса з найвищими індексами гетерозиготности (ІГ): D6S2678 - HLA класу I (ІГ = 91,4 %), DQIV - класу II (ІГ = 62,8 %) і D6S2925 - класу III (ІГ = 74,3 %) як потенційні маркери для дослідження внутрішньосімейного зчеплення і аналізу CNV. Висновки: продемонстровано, що обрана панель маркерів надає змогу ефективно розв'язувати обидва завдання: виявлення соматичних реорганізацій в різних ділянках локусу HLA в зразках пухлин і визначення HLA-гаплотипу для вибору підходящого родинного донора для трансплантації.

Рассмотрены некоторые особенности генерации начальной популяции при параллельной реализации многопопуляционного генетического алгоритма, а также некоторые подходы к ее оптимальному использованию. Реализованы некоторые модификации генетического алгоритма, рассмотренного в предыдущих работах, для уменьшения использования операции мутации для конкретной задачи. В результате удалось исключить операции мутации до достижения 98 % от оптимума, при сравнительно низком количестве рассмотренных вариантов решения (альтернатив).

Paraoxonases are produced by liver. These enzymes hydrolize and detoxify oxidized low density lipoproteins and homocysteine and have an important value in atherosclerosis development. With the aim of estimation the modern points of view onto the role of paraoxonase genes mutations in te development of cardiovascular and hepatobiliary disorders we made a literature search. It was revealed that paraoxonases are produced by liver and are associated with high density lipoproteins, hydrolize and detoxify oxidized low density lipoproteins and homocysteine. That's why their decrease leads to the high risk of development of atherosclerosis, diabetes mellitus, cholelithiasis, age-related diseases, and metabolic syndrome. Polymorphisms of genes of paraoxonase 1 (PON1-Q192R; -gln191 to arg; PON1-L55M (LL, MM, LM); G-907C, A-162G and C-108T), paraoxonase 2 (Ala/Gly in 148 position and Ser/Cys in 311 position) and paraoxonase 3 (c.449G >> A, SNPs A10340C, A2115T and introne variant of PON3 INS2 + 3651(A>G) (rs10487132)) are associated with cardiovascular and biliary diseases independently of lipid profile and smoking status due to activation of the oxidative stress and inflammation. Polymorphisms of paraoxonase genes are the common genetic background of heart and gallbladder disorders.