Polishchuk L. V. New strains of streptomycetes in which genomes clusters of genes for agarose catabolism were revealed = Нові штами стрептоміцетів, в геномах яких виявлено кластери генів катаболізму агарози / L. V. Polishchuk // Фізіологія рослин і генетика. - 2023. - 55, № 6. - С. 519-527. - Бібліогр.: 17 назв. - англ.Агароза - полісахарид, що міститься в клітинних стінках червоних водоростей. Більшість виявлених агаролітичних мікроорганізмів є грамнегативними бактеріями з кількох таксономічно різноманітних груп, але було виявлено також кілька грампозитивних, наприклад, Bacillus sp. MK03, Streptomyces coelicolor А3(2). S. coelicolor A3(2) ферментує агарозу за допомогою 3 різних гідролаз: двох позаклітинних <$beta>-агараз (DagA і DagB) і внутрішньоклітинної <$Ealpha>-неоагаробіозної гідролази ScJCl 17. Мета роботи полягала в ідентифікуванні штамів стрептоміцетів, геноми яких містять послідовності, подібні до генів, що кодують білки агаролітичної системи S. coelicolor А3(2). Об'єктами дослідження були нуклеотидні послідовності стрептоміцетів, депоновані в базах даних Національного центру біотехнологічної інформації (NCBI, США). Аналіз первинних структур ДНК стрептоміцетів проводили за допомогою програм BLASTN на сервері NCBI. BLASTN-аналіз інформації в базах даних NCB1 виявив наявність у них 5 таких штамів (Streptomyces sp. SID7813, Streptomyces sp. NRRL В-16638, Streptomyces sp. ME02-6977A, Streptomyces sp. SM1, Streptomyces sp. S4.7). їх послідовності містять фрагменти, подібні генам S. coelicolor А3(2), які кодують агаролітичні ферменти та особливу NA2-транспортну систему неоагаробіози. На підставі схожості послідовностей їх "генів господарювання" (rpoB, rrnA, gyrB, atpB, trpB, recA) зроблено висновки про близьке споріднення 4 штамів (Streptomyces sp. SID7813, Streptomyces sp. NRRL В-16638, Streptomyces sp. ME02-6977A, Streptomyces sp. SM1) і S. coelicolor A3(2). Штам Streptomyces sp. S4.7 належить до штамів іншого виду (A. niveus).
Шифр НБУВ: Ж61831 Пошук видання у каталогах НБУВ
Повний текст Наукова періодика України
 Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"
|