Мікроскопічні гриби, включно дріжджі, є важливою частиною мікробіоти людини. Серед них дріжджі роду Candida дуже поширені і часто становлять переважну частину мікобіоти. Candida spp., включно Candida albicans і види кандид non-albicans, можуть бути умовно-патогенними мікроорганізмами, що уражують людей із пригніченою імунною системою. Проблема з деякими видами кандид non-albicans, наприклад C. glabrala і C. krusei, полягає в тому, що вони є високорезистентними до протигрибкової терапії та, разом з тим, їх складно точно ідентифікувати на видовому рівні загальноприйнятими в клініці біохімічними методами. Мета роботи - точна молекулярно-генетична ідентифікація за допомогою кількох генетичних маркерів дріжджового ізоляту MF22_1 з мокротиння людини, який за попередніми даними імовірно належав до Candida spp. Автори використали чотири фрагменти його хромосомної ДНК, секвеновані та депоновано ними в базі даних GenBank NCBI: ITS (GenBank ОМ479428, 548 п.н.), 28S рРНК (ОМ479513, 607 п.н.), 18S рРНК (ОМ4794321, 737 п.н.) і ген РНК-полімерази II - RPB2 (ОМ524388, 1217 п.н.). Частину бази даних колекції нуклеотидів [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/], що містить інформацію про нуклеотидну структуру ДНК грибів (таксид: 4751), було досліджено за допомогою BLASTN [http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi]. BLASTN аналіз показав, що всі чотири секвеновані генетичні маркери: ITS, 28S рРНК, 18S рРНК і RPB2 досліджуваного ізоляту MF22_1 мають максимальну схожість з відповідними послідовностями типових штамів виду Pichia kudriavzevii. Таким чином, було встановлено, що ізолят належить до виду Pichia kudriavzevii, анаморфою якого (або його неаскоспоровим станом) є Candida krusei. Цей всюдисущий у навколишньому середовищі вид є звичайним клінічним ізолятом, відповідальним за приблизно 2 % випадків дріжджових інфекцій, спричинених видами роду Candida у людей. Порівняльний аналіз первинної структури ділянки ITS продемонстрував велику подібність послідовності ITS Pichia kudriavzevii MF22_1 до більшості інших клінічних ізолятів Pichia kudriavzevii з мокротиння, калу, крові тощо, які зберігаються в різних колекціях культур установ, що спеціалізуються на медичних дослідженнях дріжджів, у всьому світі. Для цих клінічних ізолятів Pichia kudriavzevii не спостерігалося чіткої кореляції між послідовностями ITS і типом біоматеріалу, відібраного у людей.

  Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"