За допомогою методу абсорбційної спектроскопії проведено оцінку можливості використання нового ціанінового барвника АКЗ-1 для детектування та характеризації патогенних білкових агрегатів, амілоїдних фібрил. Спектри поглинання АКЗ-1 в органічному розчиннику диметилсульфоксиді (ДМСО) характеризуються наявністю вібронної структури, причому відносна інтенсивність субсмуги 0-0 вище, ніж інтенсивність субсмуги 0-1. У водній фазі відбувався гіпсохромний зсув спектра поглинання АКЗ-1 відносно ДМСО, зумовлений H-агрегацією барвника. За взаємодії АКЗ-1 з нативним та фібрилярним інсуліном спостерігалось зменшення інтенсивності мономерної спектральної смуги та зростання інтенсивності смуги H-димерів. Для оцінки відносних внесків пономерної та агрегованої форм барвника , було проведено деконволюцію спектрів поглинання зв'язаного з білком АКЗ-1 з використанням асиметричної лог-нормальної (LN) функції. Аналіз набору параметрів, одержаних у процесі підгонки, вказує на самоасоціацію АКЗ-1 в димери типу "голова до голови" викликану білком, причому величина цього ефекту була значно більш виражена за присутності фібрилярного білка. З використанням методу молекулярного докінгу показано, що мономери АКЗ-1 зв'язуються зі специфічно розміщеними боковими ланцюгами <$Ebeta>-листа, що сформовані залишками лейцину L17 (В ланцюга інсуліну) та знаходяться на повністю недоступній для води поверхні - стеричній блискавці. В той же час, димери барвника формують стабільні комплекси з жолобками фібрил, що утворені амінокислотними залишками Q15 та E17 ланцюга А та розташовані на доступній для розчинника поверхні. Сайт зв'язування Q15_Е17 є більш доступним для барвника, а також додатково стабілізується електростатичною взаємодією між позитивно зарядженим барвником та залишком E17. Останній механізм взаємодії уявляється переважним у порівнянні з механізмом зв'язування мономерів з фібрилами. Одержані результати надають змогу рекомендувати АКЗ-1 як перспективний амілоїдний маркер, поряд з класичними репортерськими молекулами Тіофлавіном T та Конго червоним.

 Наукова періодика України 

---

Додаткова інформація про автора(ів) публікації:
(cписок формується автоматично, до списку можуть бути включені персоналії з подібними іменами або однофамільці)

• Трусова Валерія Михайлівна (біологічні науки)

  Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"