Патыка Н. В. Оценка метагенома и детекция функционально значимых полиморфизмов прокариот почвы с использованием метода пиросеквенирования / Н. В. Патыка, А. Ю. Колодяжный, И. И. Ибатуллин // Мікробіол. журн.. - 2016. - 78, № 2. - С. 43-51. - Библиогр.: 17 назв. - рус.Проведена оценка метагенома и функционально значимых филогенетических и таксономических полиморфизмов прокариот в черноземе типичном под пшеницей озимой с использованием метода пиросеквенирования. Выявлено 1708 операционных таксономических единиц и 335 таксонов прокариот. Установлено, что в структуре метагенома прокариот чернозема типичного были представители 2-х архейных и 22-х бактериальных фил, абсолютные доминанты относились к Proteobacteria - 79,6 % и Actinobacteria - 12,9 %. Полиморфизм представленности прокариотных таксонов наблюдали на уровне семейств; доминирующими при этом были: Alcaligenaceae, Pseudomonadaceae, Solirubrobacteraceae, Gaiellaceae, Nitrososphaeraceae. Показано филогенетические связи между основными представителями метагенома прокариот, сформировавшиеся в черноземе типичном агроценоза пшеницы озимой. Таким образом, использование метода пиросеквенирования, кроме оценки структуры и разнообразия, открывает перспективы для исследования функциональной составляющей метагенома прокариот почвы. Індекс рубрикатора НБУВ: Е40*446.33 + П034.17-26
Рубрики:
Шифр НБУВ: Ж22205 Пошук видання у каталогах НБУВ Повний текст Наукова періодика України Додаткова інформація про автора(ів) публікації: (cписок формується автоматично, до списку можуть бути включені персоналії з подібними іменами або однофамільці) Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"
|