Наукова періодика України Український антарктичний журнал


Бублик О. М. 
Біоінформатичне передбачення генів індукованих холодом транскрипційних факторів CBF/DREB1 та DREB4 у Deschampsia antarctica Desv. / О. М. Бублик, І. О. Андрєєв, В. А. Кунах // Український антарктичний журнал. - 2016. - № 15. - С. 81-95. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/uazh_2016_15_10
Мета роботи - дослідження механізмів стійкості до стресів у рослин на прикладі антарктичного злаку D. antarctica, зокрема аназіз генів транскрипційних факторів із груп CBF/DREBI та DREB4, відповідальних за регуляцію реакції на холодовий та інші абіотичні стреси. Шляхом аналізу даних розшифровування геномної ДНК та мРНК D. antarctica із використанням як референених послідовностей ідентифікованих генів споріднених видів злаків та деяких типових мотивів передбачено in sihco існування 17 генів-кандидатів з досліджуваних груп. Передбачені гени DaCBF охарактеризовано та класифіковано шляхом порівняння із послідовностями описаних раніше ортологів інших видів, а також присвоєно їм назви за прийнятою для інших злаків номенклатурою. Проаналізовано склад кластерів цих генів та їх можливу роль у формуванні холодостійкості виду. Встановлено, що послідовності білкових продуктів передбачених генів містять характерні для цих груп ДНК-зв'язувальний домен AP2/ERF та консервативні мотиви, а також показано їх високу гомологію до білків-ортологів споріднених видів рослин. Філогенетичний аназіз показав, що структура групи передбачених транскрипційних факторів D. antarctica у цілому подібна до описаної для інших злаків: до нечисленних підгруп CBFI та CBFII увійшло по одному ТФ, до більш численних груп CBFIII та CBFIV - відповідно 4 та 8. До кластеру DREB4 увійшли 3 ТФ. Аналіз транскриптомних послідовностей показав конститутивну експресію ТФ з груп CBFIIIc, CBF IV та DREB4. Не вдалося виявити суттєвих особливостей чисельності та складу груп DREB1/CBF та DREB4 передбачених ТФ, які б пояснювати підвищену холодостійкість D. antarctica.
  Повний текст PDF - 646.333 Kb    Зміст випуску     Цитування публікації

Цитованість авторів публікації:
  • Бублик О.
  • Андрєєв І.
  • Кунах В.

  • Бібліографічний опис для цитування:

    Бублик О. М. Біоінформатичне передбачення генів індукованих холодом транскрипційних факторів CBF/DREB1 та DREB4 у Deschampsia antarctica Desv. / О. М. Бублик, І. О. Андрєєв, В. А. Кунах // Український антарктичний журнал. - 2016. - № 15. - С. 81-95. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/uazh_2016_15_10.

    Додаткова інформація про автора(ів) публікації:
    (cписок формується автоматично, до списку можуть бути включені персоналії з подібними іменами або однофамільці)
  • Бублик Олена Миколаївна (біологічні науки)
  • Андрєєв Ігор Олегович (біологічні науки)
  • Кунах Віктор Анатолійович (1946–) (біологічні науки)
  •   Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"
     
    Відділ інформаційно-комунікаційних технологій
    Пам`ятка користувача

    Всі права захищені © Національна бібліотека України імені В. І. Вернадського