Наукова періодика України Доповіді Національної академії наук України


Войтешенко І. С. 
Конформаційний аналіз низькомолекулярної моделі цукрово-фосфатного кістяка натрієвої ДНК / І. С. Войтешенко, Р. О. Жураківський, Л. А. Булавін, Д. М. Говорун // Доповiдi Національної академії наук України. - 2011. - № 7. - С. 173-180. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/dnanu_2011_7_32
Вперше за допомогою квантово-механічного методу на рівні теорії MP2/6-311++G(2df,pd)//DFT B3LYP/6-31++G(d,p) конформаційно проаналізовано низькомолекулярну сполуку, що моделює аніонний цукрово-фосфатний кістяк (ЦФК) ДНК. Установлено, що з усіх можливих конформерів лише 12 є твірними ЦФК A-подібних форм ДНК. Не зафіксовано твірних конформерів ЦФК B-подібних форм ДНК. Виявлено 231 твірний конформер ЦФК P-подібних форм ДНК, що мають широкий спектр конформацій цукрів, найчисленнішими серед яких є C1'-exo та C3'-endo.Уперше за допомогою квантово-механічного методу на рівні теорії MP2/6-311++G(2df,pd)//DFT B3LYP/6-31G(d,p) проведено повний конформаційний аналіз низькомолекулярної натрієвої сполуки, що моделює електронейтральний цукрово-фосфатний кістяк (ЦФК) ДНК. Встановлено, що з усіх 8959 можливих конформерів лише 51 є твірними ЦФК А-подібних форм ДНК. Не виявлено модельних А-подібних форм ДНК із нативними значеннями всіх торсійних кутів. Зафіксовано 53 твірних конформери ЦФК В-подібних форм ДНК, 6 з яких мають ідентичний до природних набір номенклатурних торсійних кутів alpha, beta, gamma, delta, epsilon і zeta. Виявлено 426 твірних конформерів ЦФК Р-подібних форм ДНК з цукрами C2'-endo та C3'-endo. Решта 509 сполук мають широкий спектр конформацій цукрів, найчисленнішими серед яких є C1'-exo та C4'-endo. Одержані результати узгоджуються з попередніми дослідженнями модельного біцукрового залишку, в яких фосфатна група нейтралізована протоном, і розширюють існуючі уявлення про конформаційну будову та мінливість макромолекули ДНК.
  Повний текст PDF - 520.282 Kb    Зміст випуску     Цитування публікації

Цитованість авторів публікації:
  • Войтешенко І.
  • Жураківський Р.
  • Булавін Л.
  • Говорун Д.

  • Бібліографічний опис для цитування:

    Войтешенко І. С. Конформаційний аналіз низькомолекулярної моделі цукрово-фосфатного кістяка натрієвої ДНК / І. С. Войтешенко, Р. О. Жураківський, Л. А. Булавін, Д. М. Говорун // Доповiдi Національної академії наук України. - 2011. - № 7. - С. 173-180. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/dnanu_2011_7_32.

    Додаткова інформація про автора(ів) публікації:
    (cписок формується автоматично, до списку можуть бути включені персоналії з подібними іменами або однофамільці)
  • Булавін Леонід Анатолійович (1945–) (фізико-математичні науки)
  •   Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"
     
    Відділ інформаційно-комунікаційних технологій
    Пам`ятка користувача

    Всі права захищені © Національна бібліотека України імені В. І. Вернадського