З 53-х зразків планктону та перифітону, зібраних на 14-ти станціях р. Яркон протягом 2003 - 2004 рр. визначено 247 видів водоростей з 5-ти відділів, з них 204 види (82,6 %) є індикаторами екологічних умов. На підставі розподілу числа видів в екологічних групах води р. Яркон можна охарактеризувати як прісні, середньомінералізовані або солонуваті, помірні щодо температури, слабкопроточні, лужні, які дозволяють водоростям розвиватися як в планктоні, так і на субстратах. Індикатори сапробності за Ватанабе свідчать про помірний рівень забруднення ріки. Індекси сапробності S за Сладечеком змінювалися від 1,31 (у витоці) до 2,88 (навпроти промзони Петах - Тиква), що відповідає II - IV класам якості води. Здатність до самоочищення води в р. Яркон є достатньо розвиненою та відповідає оліго- до <$E alpha>-мезосапробної зонам самоочищення. Індекси забруднення EPI змінювалися від 2-х до 4-х і вказували на малозабруднені до дуже забруднених вод II - III класів. Індекси стану екосистеми (WESI) показують, що в маловодний сезон слід очікувати токсичний вплив на водорості. Індекси забруднення ріки за сапробністю (RPIs = 2,3), електропровідністю (RPI<$E epsilon> = 2,0-2,7), нітратним азотом (RPIN = 1 - 8) і pH (RPIpH = 7,7 - 7,8) показують, що води р. Яркон є лужними, середньої мінералізації зі спорадичним притоком нітратів протягом року, відповідають III класу якості води і <$E beta>-мезосапробній зоні самоочищення. За результатами вдалося охарактеризувати ступінь самоочисної здатності ріки на базі нових зарубіжних методик і запропонувати показники для паспортизації водних об'єктів і моніторингу. Результати оцінок підтверджують можливість застосування методів біоіндикації якості середовища за водоростями водних об'єктів Ізраїлю.