За последние 20 лет получено значительное количество данных, свидетельствующих о взаимодействии эндофитов с растениями. Однако, цито- и физиолого-экологические особенности микробно-растительных взаимоотношений в эндосфере, непосредственное взаимодействие микроорганизмов с тканями растений и пространственная архитектура таких взаимодействий остаются малоизученными. С целью исследования растительно-микробных взаимоотношений и определения микроорганизмов эндосферы бамбука Phyllostachys atrovaginata был адаптирован и применён модифицированный метод стёкол обрастаний Холодного. В результате выявлены in situ эндофитные микробные сообщества бамбука. На конфокальном микроскопе проведен их цитохимический анализ. Применение метода электронной сканирующей микроскопии позволило выявить в тканях побегов бамбуков колонии эндофитов.