Yesylevskyy S.
Comparison of empirical force fields for bacteriochlorophyll: an influence on hydration and long-time dynamics of bacterial photoreaction centers / S. Yesylevskyy, N. Berezetskaya, M. Olenchuk // Ukrainian journal of physics. - 2016. - Vol. 61, № 10. - С. 886-892. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/Ukjourph_2016_61_10_7
Вибір адекватного силового поля для фотосинтетичних кофакторів є основною передумовою проведення реалістичного моделювання бактеріальних і рослинних фотосинтетичних центрів. Порівняно 2 набори параметрів для бактеріохлорофілу у симуляціях за допомогою методу молекулярної динаміки довжиною 200 нс фотосинтетичного центру бактерії Rhodobacter Sphaeroіdes у мембранному оточенні. Показано, що найбільш популярний набір параметрів продукує артифакти у положеннях та орієнтаціях кофакторів. Також показано, що гідратація кофакторів може сильно змінюватися залежно від використаного силового поля. Надано рекомендації щодо подальшої розробки силових полів для фотосинтетичних кофакторів.
Цитованість авторів публікації:Yesylevskyy S.Berezetskaya N.
Olenchuk M.
Бібліографічний опис для цитування:
Yesylevskyy S. Comparison of empirical force fields for bacteriochlorophyll: an influence on hydration and long-time dynamics of bacterial photoreaction centers / S. Yesylevskyy, N. Berezetskaya, M. Olenchuk // Ukrainian journal of physics. - 2016. - Vol. 61, № 10. - С. 886-892. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/Ukjourph_2016_61_10_7.
Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити
"Анкету науковця"
|