Yesylevskyy S. 
Comparison of empirical force fields for bacteriochlorophyll: an influence on hydration and long-time dynamics of bacterial photoreaction centers / S. Yesylevskyy, N. Berezetskaya, M. Olenchuk // Ukrainian journal of physics. - 2016. - Vol. 61, № 10. - С. 886-892. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/Ukjourph_2016_61_10_7
Вибір адекватного силового поля для фотосинтетичних кофакторів є основною передумовою проведення реалістичного моделювання бактеріальних і рослинних фотосинтетичних центрів. Порівняно 2 набори параметрів для бактеріохлорофілу у симуляціях за допомогою методу молекулярної динаміки довжиною 200 нс фотосинтетичного центру бактерії Rhodobacter Sphaeroіdes у мембранному оточенні. Показано, що найбільш популярний набір параметрів продукує артифакти у положеннях та орієнтаціях кофакторів. Також показано, що гідратація кофакторів може сильно змінюватися залежно від використаного силового поля. Надано рекомендації щодо подальшої розробки силових полів для фотосинтетичних кофакторів.
  Повний текст PDF - 907.821 Kb    Зміст випуску     Цитування публікації

Цитованість авторів публікації:
  • Yesylevskyy S.
  • Berezetskaya N.
  • Olenchuk M.

  • Бібліографічний опис для цитування:

    Yesylevskyy S. Comparison of empirical force fields for bacteriochlorophyll: an influence on hydration and long-time dynamics of bacterial photoreaction centers / S. Yesylevskyy, N. Berezetskaya, M. Olenchuk // Ukrainian journal of physics. - 2016. - Vol. 61, № 10. - С. 886-892. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/Ukjourph_2016_61_10_7.

      Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"
     
    Відділ інформаційно-комунікаційних технологій
    Пам`ятка користувача

    Всі права захищені © Національна бібліотека України імені В. І. Вернадського