Наукова періодика України Ukrainian food journal


Zhilinskaia N. 
Using of bioinformatics and computer morphometry in study of Fusarium spp. causing potato dry rot / N. Zhilinskaia, J. Bazarnova, A. Shleikin, L. Peshuk, O. Galenko // Ukrainian food journal. - 2016. - Vol. 5, Issue 3. - С. 515-522. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/UFJ_2016_5_3_10
Мета дослідження - оцінити можливість застосування методів комп'ютерної морфометрії та біоінформаційного аналізу для вивчення реактивних змін клітин грибів Fusarium spp., які викликають суху картопляну гниль. Для проведення досліджень відібрано бульби картоплі сорту "Невський" із зовнішніми ознаками фузаріозної сухої гнилі. Вивчено 3 зони рослинної тканини картопляних бульб: епіцентр контамінації пліснявих грибів роду Fusarium; тканини, прилеглі до вогнища ураження; тканини поза зоною осередку ураження. Препарати Fusarium spp. одержано за допомогою методу "відбитка" з рослинної тканини, фіксовані мікроорганізми фарбували 1 % розчином метиленового синього. Морфологічне дослідження та комп'ютерну морфометрію мікроорганізмів проведено за загального збільшення х400 і х1000 мікроскопа "Micros" (Austria), модель MS 100 (XP). Морфометричні характеристики макроконідій Fusarium spp. (площа, периметр, довжина, кількість) одержано з застосуванням комп'ютерної програми аналізатора зображень "Micros". На підставі даних морфометричного аналізу клітин грибів розроблено алгоритм і комп'ютерну програму для вивчення біоінформаційних характеристик макроконідій Fusarium spp. Для встановлення термодинамічної рівноваги клітинної системи обчислено такі інформаційні характеристики: H - інформаційна ентропія, що характеризує ступінь упорядкованості біосистеми; Hmax - інформаційна ємність, що характеризує максимальну структурну різноманітність біосистеми з такими, що втратили функціональний взаємозв'язок елементами; R - коефіцієнт надмірності (відносної організації біосистеми). Для досліджених грибів роду Fusarium виявлено низькі значення H (0002) щодо значень Hmax (0,5) на тлі підвищених значень R (99,40 - 99,69 %), що характеризують упорядкованість і високий рівень відносної організації в мікробних клітинах, що вражають бульби картоплі. Ця інформація може вказувати на максимальний ступінь адаптації клітин паразитуючих грибів роду Fusarium до умов їх біоценозу з рослинними клітинами в процесі мікробної контамінації бульб картоплі. Слід очікувати , що в разі реакції грибів роду Fusarium на вплив хімічних або біопрепаратів значення H повинні зростати до значень інформаційної Hmax, а значення R - зменшуватися. Зміни показників можна буде трактувати як результат дезінтеграції структурних і функціональних зв'язків у клітинній системі грибів роду Fusarium.
  Повний текст PDF - 826.064 Kb    Зміст випуску     Цитування публікації

Цитованість авторів публікації:
  • Zhilinskaia N.
  • Bazarnova J.
  • Shleikin A.
  • Peshuk L.
  • Galenko O.

  • Бібліографічний опис для цитування:

    Zhilinskaia N. Using of bioinformatics and computer morphometry in study of Fusarium spp. causing potato dry rot / N. Zhilinskaia, J. Bazarnova, A. Shleikin, L. Peshuk, O. Galenko // Ukrainian food journal. - 2016. - Vol. 5, Issue 3. - С. 515-522. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/UFJ_2016_5_3_10.

      Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"
     
    Відділ інформаційно-комунікаційних технологій
    Пам`ятка користувача

    Всі права захищені © Національна бібліотека України імені В. І. Вернадського