С использованием методов рентгенофазового анализа и ядерного магнитного резонанса исследованы формы вхождения протонов и кремния и особенности структуры метамиктного (с высоким содержанием U) и кристаллического циркона из гранитов Украинского щита. Показано, что в структуре метамиктного образца (поглощенная доза <$E D~symbol Ы~8~cdot~10 sup 18> <$E alpha>-распад/г, III стадия метамиктизации) присутствуют кристаллическая и аморфная фазы циркона. Последняя содержит, кроме того, небольшое количество слабоупорядоченной фазы кварца, аморфного гидратированного кремнезема (<$E {roman Si} sub 1-x {roman O} sub 2-x ( roman OH ) sub x>) и, предположительно, аморфного ZrO2, который при отжиге трансформируется в t-ZrO2. Структура циркона с низким содержанием U (поглощенная доза <$E D~symbol Ы~2~cdot~10 sup 18> <$E alpha>-распад/г, I стадия метамиктизации) в основном кристаллическая, с небольшой примесью аморфной фазы циркона. В метамиктном цирконе присутствуют OH-группы (1,2 мас. % H2O), преимущественно Si-OH-группы в аморфном гидратированном кремнеземе. В цирконе I стадии метамиктизации таких групп на порядок меньше (0,1 мас. % H2O). Предположено, что количество OH-групп в метамиктной фазе циркона отражает активность воды в магматической и постмагматической истории минерала. Показано, что в метамиктном и кристаллическом цирконе в граничном слое зоны на расстоянии до 2 нм от оси трека ядра отдачи могут формироваться фазы SiO2 и ZrO2 вследствие более быстрого понижения температуры, чем в остальной структуре. Показано, что структура метамиктного циркона рекристаллизуется на <$E symbol Ы~90> % в температурном интервале <$E T~=~600~-~1000~symbol Р>C в течение трех часов и сопровождается частичным перераспределением OH-групп в структуре, частичной дегидроксилацией аморфной фазы, снижением ее количества, образованием и исчезновением фазы t-ZrO2.