Мета роботи - встановити спорідненість нуклеотидних послідовностей гену 16S рРНК 10 ізольованих штамів Erwinia sp. та 9 колекційних штамів "Erwinia horticola" з типовими представниками роду Erwinia для їх коректної ідентифікації на рівні виду. Об'єкти - 10 ізольованих з уражених тканин яблуні штамів Erwinia sp. та 9 колекційних штамів "Erwinia horticola". ДНК-копію гену 16S рРНК ампліфікували з використанням універсальних праймерів pA та pH. Побудову зворотнього компліменту, редагування, вирівнювання і елаймент послідовностей здійснювали за допомогою програм Multalin і Sequence Manipulation Suite. Пошук гомологічних, задепонованих в GenBank, нуклеотидних послідовностей гену 16S рРНК проводили, використовуючи програму BLASTN. Для побудови дендрограми філогенетичних зв'язків застосовували програму MEGA 5. Аналіз нуклеотидної послідовності гену 16S рРНК встановив високий рівень гомології (99 - 98 %) досліджуваних штамів з типовими штамами видів E. amylovora, E. pyrifoliae, E. piriflorinigrans, E. uzenensis, E. billingiae, E. persicina, E. aphidicola. Висновки: зважаючи на досліджений раніше комплекс ознак фенотипу та встановлену гомологію нуклеотидних послідовностей гену 16S рРНК, можна стверджувати, що найбільш вірогідною є спорідненість ізольованих авторами штамів Erwinia sp. та колекційних штамів "Erwinia horticola" саме з типовими штамами видів E. amylovora та E. pyrifoliae. Оскільки, згідно даних літератури, ці види близькоспоріднені та погано диференціюються за гомологією нуклеотидних послідовностей гену 16S рРНК, для остаточної видової ідентифікації досліджуваних штамів роду Erwinia необхідно залучення інших генотипових ознак.

  Повний текст PDF - 431.871 Kb    Зміст випуску     Цитування публікації

  Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"