З'ясування факторів, що визначають типи і темпи замін нуклеотидів у геномах, має важливе значення для вдосконалення розповсюджених моделей молекулярної еволюції, дослідження еволюційного процесу, розпізнавання кодуючих і некодуючих РНК, ідентифікації біологічно важливих мотивів, а саме: реплікаційних сигналів, регуляторних ділянок тощо. Однак, багато питань стосовно факторів, що впливають на заміни нуклеотидів у геномах вірусів рослин, все ще залишаються не з'ясованими. Проведено порівняльний комп'ютерний аналіз замін нуклеотидів у геномних сиквенсах десяти пар близько споріднених штамів Х-вірусу картоплі з однаковою довжиною геномів і генів. Виявлено значне варіювання частоти замін залежно від пар нуклеотидів і штамів, довжини та локалізації ділянок геномів і генів, а також типу замін та їх кодонних позицій. Найбільші відношення частот замін знайдено в різних парах нуклеотидів (<$Eu~symbol О~c "/" c~symbol О~g>, 1240), кодонних позиціях (третя/друга, 17,3) та типах (транзиції/трансверсії, 5,8); найменші - у прямих і зворотних замін нуклеотидів однієї пари (1,03 - 1,6). Частота трансверсій набагато менша, але значно більш варіабельна, ніж транзицій, і не має чіткої залежності від довжини гена (нуклеотидної ділянки).

  Повний текст PDF - 429.651 Kb    Зміст випуску     Цитування публікації

  Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"