Наукова періодика України Microbiological journal


Кириченко А. М. 
Вибірковість кодонів і заміни нуклеотидів у генах вірусу карликовості сої / А. М. Кириченко, О. І. Гордейчик, І. С. Щербатенко // Мікробіологічний журнал. - 2012. - Т. 74, № 3. - С. 90-97. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/MicroBiol_2012_74_3_15
Проведено комп'ютерний аналіз вибірковості кодонів і спонтанних замін нуклеотидів у шести штамів вірусу карликовості сої. Встановлено, що частота використання синонімічних кодонів у вірусних генах широко варіює залежно від гена, перекривання генів, кодона, послідовності перших двох кодонних нуклеотидів, однонуклеотидних контекстів, локалізованих перед кодоном і за ним, а також від вмісту GC (G+C) у генах і в третій позиції кодонів. Під впливом перекривання генів загальна кількість нуклеотидних замін зменшується в 2,5 разів, кількість еквівалентних замін у третій позиції кодонів - у 2,8 - 4,3 рази, вміст дикодонів у генах - у 1,4 - 1,6 разів. Поряд із цим спостерігається збільшення кількості нееквівалентних замін нуклеотидів у другій кодонній позиції, а також висока вибірковість кодонів (Fop = 0,94 - 1,0) і кореляція між вмістом нуклеотидів у генах і третіх позиціях кодонів (r = 0,73 - 0,74). Одержані результати свідчать про наявність селекції дикодонів у вірусних генах.
  Повний текст PDF - 412.575 Kb    Зміст випуску     Цитування публікації

Цитованість авторів публікації:
  • Кириченко А.
  • Гордейчик О.
  • Щербатенко І.

  • Бібліографічний опис для цитування:

    Кириченко А. М. Вибірковість кодонів і заміни нуклеотидів у генах вірусу карликовості сої / А. М. Кириченко, О. І. Гордейчик, І. С. Щербатенко // Мікробіологічний журнал. - 2012. - Т. 74, № 3. - С. 90-97. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/MicroBiol_2012_74_3_15.

    Додаткова інформація про автора(ів) публікації:
    (cписок формується автоматично, до списку можуть бути включені персоналії з подібними іменами або однофамільці)
  • Кириченко Ангеліна Миколаївна (біологічні науки)
  • Щербатенко Іван Степанович (біологічні науки)
  •   Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"
     
    Відділ інформаційно-комунікаційних технологій
    Пам`ятка користувача

    Всі права захищені © Національна бібліотека України імені В. І. Вернадського