Наукова періодика України | Microbiological journal | ||
Гордейчик О. І. Контексти супресивних термінальних кодонів трансляції генів РНК‑вмісних вірусів рослин / О. І. Гордейчик, І. С. Щербатенко // Мікробіологічний журнал. - 2010. - Т. 72, № 6. - С. 58-65. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/MicroBiol_2010_72_6_11 Проведено комп'ютерний пошук в генетичних банках даних супресивних термінальних кодонів трансляції (СТКТ) генів вірусів рослин та порівняльний аналіз контекстів супресії цих кодонів. Встановлено, що в геномах вірусів рослин найчастіше супресуються стоп-кодони UAG (167 із 211, 79,1 %), рідше - UGA (37/211, 17,5 %) і зовсім рідко - UAA (7/211, 3,3 %). Більшість слабких (супресивних) термінальних кодонів у відносній позиції +4 містять гексануклеотидні сайти caauua, cgguuu, gggugc, ggaggc або guagac, які вважаються важливими (консенсусними) елементами контекстів СТКТ РНК-вмісних вірусів рослин, тварин і мікроорганізмів. Поряд із цим у генах багатьох вірусів спостерігається широка мінливість послідовностей консенсусних гексануклеотидних сайтів, а також додаткові позиції їх локалізації в різних рамках зчитування і на різних відстанях від термінальних кодонів. Характерною рисою супресивних термінальних кодонів трансляції є наявність кластерів збіжних нуклеотидних сайтів у різних родів вірусів на ділянках довжиною до кількох сотень нуклеотидів від цих кодонів. Результати проведених досліджень підтримують припущення про те, що ефективність трансляції, а також прочитування стоп-кодонів можуть бути детерміновані на рівні геномів чи генів, а не лише короткими контекстами, що оточують термінальні кодони. Цитованість авторів публікації: Бібліографічний опис для цитування: Гордейчик О. І. Контексти супресивних термінальних кодонів трансляції генів РНК‑вмісних вірусів рослин / О. І. Гордейчик, І. С. Щербатенко // Мікробіологічний журнал. - 2010. - Т. 72, № 6. - С. 58-65. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/MicroBiol_2010_72_6_11.Додаткова інформація про автора(ів) публікації: (cписок формується автоматично, до списку можуть бути включені персоналії з подібними іменами або однофамільці) Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"
|
|
Всі права захищені © Національна бібліотека України імені В. І. Вернадського |