Наукова періодика України | Microbiological journal | ||
Гордейчик О. І. Контексти стартових кодонів трансляції генів тобамо- і потексвірусів / О. І. Гордейчик, І. С. Щербатенко // Мікробіологічний журнал. - 2010. - Т. 72, № 1. - С. 39-46. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/MicroBiol_2010_72_1_8 Проведено комп'ютерний аналіз контекстів (нуклеотидного оточення) канонічного стартового кодона трансляції AUG у 15 тобамовірусів (45 генів) і 22 потексвірусів (110 генів). Встановлено, що контексти AUG вірусів рослин мають як високу схожість із відповідними контекстами еукаріотів, так і деякі особливості. Схожість проявляється в локалізації збіжних нуклеотидів поблизу стартового кодона (в позиціях -3... +18), наявності пурина в позиції -3 (-3R) і гуаніна в позиції +4 (+4G) відносно кодона AUG, а також у подібності трансляційних контекстів вірусів відповідним контекстам хребетних тварин (16,9 - 52,4 %) та однодольних (21,9 - 41,2 %) і дводольних рослин (39,3 - 74,3 %). Характерною особливістю вірусних трансляційних контекстів є висока частота компонентів +5С, -5Y і +10R, а також широке варіювання частоти контекстних елементів у різних вірусів і/або генів. Обговорено запропонований показник подібності трансляційних контекстів відомим консенсусним послідовностям. Цитованість авторів публікації: Бібліографічний опис для цитування: Гордейчик О. І. Контексти стартових кодонів трансляції генів тобамо- і потексвірусів / О. І. Гордейчик, І. С. Щербатенко // Мікробіологічний журнал. - 2010. - Т. 72, № 1. - С. 39-46. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/MicroBiol_2010_72_1_8.Додаткова інформація про автора(ів) публікації: (cписок формується автоматично, до списку можуть бути включені персоналії з подібними іменами або однофамільці) Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"
|
|
Всі права захищені © Національна бібліотека України імені В. І. Вернадського |