Наукова періодика України Цитологія і генетика


Дмитренко В. В. 
Определение молекулярных подклассов глиобластом на основе анализа экспрессии генов / В. В. Дмитренко, А. В. Ершов, П. И. Стецюк, А. П. Лиховид, Ю. П. Лаптин, Д. Р. Шварц, А. А. Меклер, В. М. Кавсан // Цитология и генетика. - 2014. - Т. 48, № 6. - С. 45-55. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/CLG_2014_48_6_9
Две группы глиобластом, отличающихся между собой по уровню экспрессии 416-ти генов (<$EP~symbol Г~0,05>), определены с применением математической модели в форме линейного булевого программирования на основе наявных в базе данных Gene Expression Omnibus (GEO) no экспрессии генов в глиобластомах, полученных с помощью анализа микрочипов. Уровень экспрессии 15-ти генов более чем в 2 раза выше в первой группе глиобластом (80 образцов) по сравнению со второй группой (144 образца), а 401-го гена - более чем в 2 раза ниже по сравнению со второй группой. Из 15-ти генов, уровень экспрессии которых преобладает в первой группе глиобластом, 10 кодируют белки, вовлеченные в регуляцию клеточного цикла и пролиферации клеток. Значительную часть 401-го гена составляют гены, которые кодируют белки, вовлеченные в функционирование нейральных клеток и принимающие участие в таких процессах, как синаптическая передача, нейрогенез, образование миелиновой оболочки и аксонов. Карта Кохонена, построенная на основе данных 15-ти генов, уровень экспрессии которых превалирует в первой группе, и 60-ти (из 401-го) гена, уровень экспрессии которых выше во второй группе, подтвердила существование 2-х групп глиобластом со специфическими профилями экспрессии генов. Разделение глиобластом на 2 группы может отражать 2 пути развития астроцитарных глиом, один из которых приводит к образованию опухолей с более высоким уровнем экспрессии генов, белковые продукты которых вовлечены в регуляцию клеточного цикла и пролиферации. Вместе с тем существование 2-х молекулярных вариантов, возможно, является отражением различных стадий развития глиобластом.
  Повний текст PDF - 628.969 Kb    Зміст випуску     Цитування публікації

Цитованість авторів публікації:
  • Дмитренко В.
  • Ершов А.
  • Стецюк П.
  • Лиховид А.
  • Лаптин Ю.
  • Шварц Д.
  • Меклер А.
  • Кавсан В.

  • Бібліографічний опис для цитування:

    Дмитренко В. В. Определение молекулярных подклассов глиобластом на основе анализа экспрессии генов / В. В. Дмитренко, А. В. Ершов, П. И. Стецюк, А. П. Лиховид, Ю. П. Лаптин, Д. Р. Шварц, А. А. Меклер, В. М. Кавсан // Цитология и генетика. - 2014. - Т. 48, № 6. - С. 45-55. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/CLG_2014_48_6_9.

    Додаткова інформація про автора(ів) публікації:
    (cписок формується автоматично, до списку можуть бути включені персоналії з подібними іменами або однофамільці)
  • Дмитренко Володимир Володимирович (біологічні науки)
  •   Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"
     
    Відділ інформаційно-комунікаційних технологій
    Пам`ятка користувача

    Всі права захищені © Національна бібліотека України імені В. І. Вернадського