Мета роботи - визначити рівень еволюційної стабільності CNE (conserved non protein-coding element) - некодуючого функціонального елементу бакуловірусного геному, що відіграє виключну роль у патогенезі бакуловірусів. Для ідентифікації ортологічних послідовностей в геномах 50-ти альфабакуловірусів застосовували NCBI-BLAST. Ортологічні послідовності вирівнювали за допомогою алгоритму вирівнювання ClustalW. Одержували матрицю значень відсотків ідентичності (percent identity, % ID) для попарних порівнянь за допомогою програми Alistat. Середній рівень ID (73 %), розрахований для 1225-членної вибірки, виявився порівнюваним з такими показниками кодуючих послідовностей найконсервативніших бакуловірусних генів polh та pif2, а також з показниками промоторних ділянок polh та p18, що є найконсервативнішими представниками невеликої групи еволюційно стабільних промоторних ділянок пізніх генів. Висновки: CNE є одним з найконсервативніших елементів геномів альфабакуловірусів.

  Повний текст PDF - 309.54 Kb    Зміст випуску     Цитування публікації

  Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"