Наукова періодика України Biopolymers and cell


Kotelnikova E. A. 
NGS-based identification of druggable alterations and signaling pathways – hepatocellular carcinoma case report / E. A. Kotelnikova, M. D. Logacheva, E. R. Nabieva, M. A. Pyatnitskiy, D. V. Vinogradov, A. S. Makarova, A. V. Demin, A. G. Paleeva, O. S. Kremenetskaya, A. A. Penin, A. V. Klepikova, A. S. Kasianov, D. A. Shavochkina, N. E. Kudashkin, Yu. I. Patyutko, N. S. Mugue, A. S. Kondrashov, N. L. Lazarevich // Biopolymers and cell. - 2015. - Vol. 31, № 6. - С. 436-446. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/BPK_2015_31_6_6
Мета роботи - ідентифікувати потенційно онкодрайверні або клінічно значущі молекулярні події у пацієнта з гепатоклітинною карциномою. У роботі застосовано методи: РНК- та екзомне секвенування пухлинної тканини та відповідного контролю. Анотування знайдених змін, використовуючи декілька загальнодоступних баз даних та біоінформатичних програм. Порівнено транскрипційний профіль досліджуваної пухлини з транскриптомами клітинних ліній з бази даних Genomics of Drug Sensitivity in Cancer. Ідентифіковано кілька генів, що дифференційно експресуються, і пов'язані як з класичною терапією сорафенібом, так і з додатковими сигнальними шляхами, що потенційно вразливі до терапії препаратами, які досліджувались у клініческих випробуваннях (ерлотініб, лапатініб та темсіролімус). Декілька гермінативних мутацій, знайдених в XRCC1, TP53 та DPYD, згідно з даними інших клінічних випробувань, можуть бути пов'язані з підвищеною чутливістю до платинових терапій та зменшеною чутливістю до 5-фторурацилу. Ідентифіковано декілька потенційно драйверних мутацій, які на цей час не можуть бути пов'язані з терапіями, наприклад делеції у CIRBP, заміни в BTG1, ERBB3, TCF7L2 тощо. Висновки: запропоноване дослідження демонструє потенційну корисність інтегрованого підходу до NGS аналізу даних, в тому числі аналізу гермінативних мутацій та транскриптому у додаток до використання онкологічних генних панелей або даних секвенування екзому.
  Повний текст PDF - 1.009 Mb    Зміст випуску     Цитування публікації

Цитованість авторів публікації:
  • Kotelnikova E.
  • Logacheva M.
  • Nabieva E.
  • Pyatnitskiy M.
  • Vinogradov D.
  • Makarova A.
  • Demin A.
  • Paleeva A.
  • Kremenetskaya O.
  • Penin A.
  • Klepikova A.
  • Kasianov A.
  • Shavochkina D.
  • Kudashkin N.
  • Patyutko Y.
  • Mugue N.
  • Kondrashov A.
  • Lazarevich N.

  • Бібліографічний опис для цитування:

    Kotelnikova E. A. NGS-based identification of druggable alterations and signaling pathways – hepatocellular carcinoma case report / E. A. Kotelnikova, M. D. Logacheva, E. R. Nabieva, M. A. Pyatnitskiy, D. V. Vinogradov, A. S. Makarova, A. V. Demin, A. G. Paleeva, O. S. Kremenetskaya, A. A. Penin, A. V. Klepikova, A. S. Kasianov, D. A. Shavochkina, N. E. Kudashkin, Yu. I. Patyutko, N. S. Mugue, A. S. Kondrashov, N. L. Lazarevich // Biopolymers and cell. - 2015. - Vol. 31, № 6. - С. 436-446. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/BPK_2015_31_6_6.

      Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"
     
    Відділ інформаційно-комунікаційних технологій
    Пам`ятка користувача

    Всі права захищені © Національна бібліотека України імені В. І. Вернадського