Мета роботи - провести біоінформатичне дослідження промоторів генів Mbl1 і Mbl2 Rattus norvegicus, що кодують манозозв'язуючі лектини, на наявність та функціональну специфічність сайтів зв'язування транскрипційних факторів. Обидві послідовності промоторів довжиною 1100 п.н. проаналізовано в програмі MatInspector за використання позиційно-вагових матриць з бази данних Matrix Family Library Version 9.0. В межах програми відібрано сайти зв'язування для транскрипційних факторів, які специфічно експресуються в печінці та клітинах імунної системи, а також, що пройшли тест щодо консервативності шляхом порівняння з сайтами зв'язування транскрипційних факторів у промоторах генів - ортологів Mus musculus. В промоторах гена Mbl1 і гена Mbl2 наявні сайти для 4-х родин транскрипційних факторів (HNF, homeodomain transcription factors, GRs and ETS factors). В промоторі гена Mbl1 виявлено також сайти для представників 6-х (AP1 related factors, Ccaat/Enhancer Binding Proteins, FOX, p53, NFAT, ISGF3), a в гені Mbl2 - для 4-х (cAMP-responsive element binding proteins, heat shock factors, Nf-кВ/с-rel and TATA binding protein) інших родин транскрипційних факторів. Характерні для гена Mbl1 транскрипційні фактори переважно задіяні в регуляції диференціювання, розвитку, підтримання гомеостаз), клітинного циклу. Через характерні для гена Mbl2 сайти транскрипційні фактори можуть опосередковувати переважно відповідь на чинники, які індукують стрес. Висновки: різноманітність транскрипційних факторів, які потенційно можуть регулювати транскрипцію обох генів, вказує на можливу участь генів в різних клітинних процесах зі специфічною функцією кожного з генів. Одержані результати є підставою для цілеспрямованого експериментального дослідження регуляції транскрипції зазначених генів.

  Повний текст PDF - 207.44 Kb    Зміст випуску     Цитування публікації

  Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"