Досліджено історію становлення органів прокуратури України у взаємозв'язку з розвитком інституту публічних фінансів. Розкрито особливості повноважень прокурора щодо захисту інтересів держави в сфері власних надходжень бюджетних установ як в системі, так і поза межами системи кримінального судочинства. Обгрунтовано положення про те, що додержання законів при формуванні та використанні власних надходжень бюджетних установ є частиною предмету захисту прокурором інтересів держави. Надано класифікацію типових порушень законодавства в сфері обігу власних надходжень. Розглянуто перспективи оптимізації цього напряму діяльності прокурорів, визначено основні критерії та способи посилення ефективності захисту прокурором інтересів держави в сфері власних надходжень бюджетних установ. Сформульовано науково обгрунтовані пропозиції щодо удосконалення чинного законодавства та відомчих нормативних актів.