На основі аналізу світового досвіду та ряду попередніх робіт авторів продемонстровані найбільш раціональні підходи до фінансування наукових досліджень, механізми його забезпечення як за рахунок Державного бюджету, так і шляхом державного стимулювання залучення для цієї мети коштів вітчизняних та зарубіжних інвесторів. Показана функціональна роль фундаментальних та прикладних досліджень в інноваційному процесі, підтверджені світовою практикою оптимальні співвідношення в забезпеченні їх ресурсами. Проаналізовано стан справ з фінансуванням науки в Україні та найважливіші проблеми в його організації, які необхідно вирішити. Виконано розрахунки можливих варіантів виходу на передбачені законодавством параметри фінансування науки і проаналізовано зумовлені ними особливості інноваційного розвитку. Розроблено пропозиції щодо вдосконалення структури бюджетних призначень та основних напрямів бюджетної політики в сфері науки та інновацій на 2005 і наступні роки.