Цель работы - изучение 23 наиболее важных иранских сортов черешни (Prunus avium), собранных в различных провинциях Ирана, и одного иностранного сорта в качестве контроля для использования в селекционных программах, с помощью 21 микросателлитного маркера и по 27 морфологическим признакам. Морфологические признаки образцов листьев, плодов и косточек оценивались на протяжении двух лет подряд. Результаты показали высокую вариабельность исследованных образцов. Большинство важных корреляций затрагивали признаки величины плодов и листьев, а также окраски. Кластерный анализ позволил разделить образцы на две различные группы. Метод главных компонент (Principal component analysis, PCA) качественных и количественных морфологических параметров объяснил более 86,59 % общей вариабельности в первых семи осях. Согласно PCA такие признаки листьев, как длина и ширина, и такие признаки плодов, как длина, ширина и вес, цвет мякоти плода и сока, были предоминантными в первых двух компонентах, что свидетельствует об их важности для определения характеристик зародышевой плазмы черешни. Из 21 SSR маркера 16 были полиморфными, давая 177 аллелей, что варьировало от 4 до 16 аллелей (в среднем 9,35) со средним уровнем гетерозиготности 0,82. Это давало успешные амплификации и выявило полиморфизм ДНК. Размер аллелей варьировал от 95 до 290 п.и. Кластерный анализ показал, что изученные генотипы черешни классифицируются в 5 главных групп, основываясь главным образом на характеристиках вида и данных SSR. В целом полученные результаты не показали ясной структуры генетической изменчивости внутри иранской области распространения черешни, так что невозможно сделать выводов об определении границ областей происхождения. Результаты исследования вносят вклад в лучшее понимание генетической изменчивости черешни в Иране, создание более эффективных программ сохранения биоразнообразия и более рациональное планирование работы с репродуктивным материалом.