Отмечено, что выбор клинициста атипичного антипсихотика может зависеть от ряда факторов, таких как эффективность, толерантность и стоимость. Также важно, чтобы выбор препарата и методов лечения учитывал предыдущий медикаментозный опыт, побочные эффекты и личные клинические характеристики пациента. Профили взаимодействия рецепторов с атипичными антипсихотиками отличаются друг от друга. За исключением амисульприда, селективного D2/D3 антагониста, все атипичные антипсихотики имеют сродство к рецепторам серотонина-2А больше, чем к рецепторам дофамина. Однако, нет доказательств, что сродство к различным рецепторам является релевантным фактором для оценки эффективности препарата. Действительно, критическим фактором может быть быстрое разобщение от D2 дофаминергических рецепторов. Толерантность также варьирует у атипичных антипсихотиков. Профиль побочных действий, возможно, связан с профилем сродства с рецепторами у различных препаратов. Обычно экстрапирамидные расстройства являются небольшой проблемой у атипичных антипсихотиков, но увеличение массы тела, снижение контроля эндогенной глюкозы, седация и гиперпролактинемия остаются проблематичными у некоторых пациентов. Амисульприд эффективен для купирования продуктивных и негативных симптомов и имеет высокую толерантность по отношению к увеличению веса, обмену глюкозы и седации. В двух клинических испытаниях, AMIRIS и SOUANOL, амисульприд продемонстрировал явные преимущества перед некоторыми другими атипичными антипсихотиками в плане купирования негативной и депрессивной симптоматики, а также увеличения веса.