Методом молекулярной механики исследованы молекулярные структуры и энергии взаимодействия комплексов "функциональный мономер - шаблон" в вакууме. В качестве функциональных мономеров рассматривались двадцать пять мономеров с различными свойствами. Ванкомицин использовался как шаблон. Показано, что в вакууме наиболее энергетически выгодным является комплексы ванкомицина с функциональными мономерами: этиленгликоль метакрилат фосфатом, N, N-метилен-бис-акриламидом, метакриламидом. Полученные результаты обосновывают выбор лучшего кандидата-мономера для создания молекулярного импринтированного полимера на ванкомицин.